Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlx1P43345 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlx1P43345 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms