Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tac1P41539 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tac1P41539 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tac1P41539 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tac1P41539 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tac1P41539 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tac1P41539 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tac1P41539 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tac1P41539 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tac1P41539 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tac1P41539 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tac1P41539 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms