Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox7P40646 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox7P40646 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox7P40646 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox7P40646 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox7P40646 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox7P40646 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox7P40646 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox7P40646 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox7P40646 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms