Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ThpoP40226 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ThpoP40226 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ThpoP40226 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ThpoP40226 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ThpoP40226 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ThpoP40226 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ThpoP40226 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms