Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik2P39087 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Grik2P39087 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grik2P39087 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grik2P39087 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grik2P39087 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik2P39087 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik2P39087 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik2P39087 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik2P39087 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik2P39087 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grik2P39087 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik2P39087 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms