Protein–RNA interactions for Protein: P38532

Hsf1, Heat shock factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf1P38532 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hsf1P38532 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hsf1P38532 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hsf1P38532 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms