Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpargP37238 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpargP37238 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpargP37238 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpargP37238 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpargP37238 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpargP37238 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PpargP37238 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpargP37238 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpargP37238 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpargP37238 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpargP37238 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpargP37238 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpargP37238 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpargP37238 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpargP37238 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpargP37238 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpargP37238 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpargP37238 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpargP37238 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpargP37238 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpargP37238 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpargP37238 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpargP37238 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PpargP37238 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpargP37238 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpargP37238 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpargP37238 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpargP37238 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpargP37238 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpargP37238 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpargP37238 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpargP37238 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpargP37238 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PpargP37238 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpargP37238 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpargP37238 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PpargP37238 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpargP37238 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpargP37238 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PpargP37238 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpargP37238 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpargP37238 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpargP37238 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpargP37238 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpargP37238 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpargP37238 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpargP37238 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpargP37238 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PpargP37238 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpargP37238 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PpargP37238 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpargP37238 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PpargP37238 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpargP37238 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PpargP37238 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpargP37238 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpargP37238 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpargP37238 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpargP37238 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpargP37238 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpargP37238 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpargP37238 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpargP37238 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpargP37238 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PpargP37238 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpargP37238 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpargP37238 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PpargP37238 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpargP37238 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpargP37238 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpargP37238 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpargP37238 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpargP37238 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpargP37238 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpargP37238 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpargP37238 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpargP37238 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpargP37238 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpargP37238 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpargP37238 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpargP37238 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpargP37238 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpargP37238 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpargP37238 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpargP37238 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpargP37238 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpargP37238 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpargP37238 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 355.2 ms