Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddit3P35639 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.1 ms