Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp4P35123 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp4P35123 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp4P35123 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp4P35123 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp4P35123 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp4P35123 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp4P35123 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp4P35123 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp4P35123 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp4P35123 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp4P35123 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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