Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gsx2P31316 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gsx2P31316 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gsx2P31316 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms