Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd28P31041 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd28P31041 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd28P31041 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd28P31041 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd28P31041 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd28P31041 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms