Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd2P30280 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnd2P30280 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnd2P30280 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms