Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha3P29319 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Epha3P29319 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha3P29319 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha3P29319 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Epha3P29319 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Epha3P29319 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha3P29319 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha3P29319 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha3P29319 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha3P29319 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms