Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa3P28310 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa3P28310 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa3P28310 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa3P28310 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa3P28310 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa3P28310 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa3P28310 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa3P28310 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa3P28310 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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