Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lef1P27782 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lef1P27782 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lef1P27782 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lef1P27782 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lef1P27782 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lef1P27782 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lef1P27782 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms