Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc5P27641 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc5P27641 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc5P27641 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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