Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af2P26369 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2af2P26369 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af2P26369 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af2P26369 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af2P26369 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af2P26369 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af2P26369 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
U2af2P26369 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms