Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnnc2P20801 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnc2P20801 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms