Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ms4a2P20490 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a2P20490 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms