Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pou5f1P20263 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou5f1P20263 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou5f1P20263 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms