Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra6P16305 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra6P16305 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms