Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd44P15379 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd44P15379 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd44P15379 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd44P15379 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cd44P15379 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd44P15379 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd44P15379 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd44P15379 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd44P15379 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms