Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col1a1P11087 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col1a1P11087 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a1P11087 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col1a1P11087 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col1a1P11087 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col1a1P11087 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a1P11087 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a1P11087 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a1P11087 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms