Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc6P10629 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxc6P10629 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc6P10629 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms