Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa9P09631 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa9P09631 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa9P09631 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms