Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa1P09022 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxa1P09022 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa1P09022 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa1P09022 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa1P09022 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms