Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Got1P05201 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Got1P05201 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Got1P05201 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Got1P05201 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Got1P05201 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Got1P05201 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Got1P05201 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Got1P05201 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Got1P05201 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Got1P05201 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Got1P05201 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Got1P05201 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Got1P05201 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Got1P05201 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Got1P05201 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Got1P05201 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Got1P05201 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Got1P05201 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Got1P05201 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Got1P05201 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Got1P05201 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Got1P05201 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Got1P05201 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Got1P05201 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Got1P05201 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Got1P05201 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Got1P05201 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Got1P05201 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Got1P05201 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Got1P05201 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Got1P05201 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Got1P05201 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Got1P05201 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Got1P05201 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Got1P05201 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Got1P05201 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Got1P05201 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Got1P05201 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Got1P05201 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Got1P05201 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Got1P05201 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Got1P05201 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Got1P05201 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Got1P05201 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Got1P05201 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Got1P05201 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Got1P05201 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Got1P05201 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Got1P05201 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Got1P05201 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Got1P05201 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Got1P05201 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Got1P05201 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Got1P05201 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Got1P05201 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Got1P05201 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Got1P05201 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Got1P05201 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Got1P05201 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Got1P05201 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Got1P05201 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Got1P05201 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Got1P05201 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Got1P05201 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Got1P05201 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Got1P05201 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Got1P05201 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Got1P05201 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Got1P05201 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Got1P05201 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Got1P05201 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Got1P05201 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Got1P05201 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Got1P05201 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Got1P05201 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Got1P05201 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Got1P05201 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Got1P05201 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Got1P05201 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Got1P05201 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Got1P05201 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Got1P05201 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Got1P05201 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Got1P05201 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Got1P05201 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Got1P05201 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Got1P05201 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Got1P05201 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms