Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hoxa7P02830 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxa7P02830 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms