Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01792 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01792 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01792 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01792 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01792 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01792 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01792 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01792 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01792 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01792 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01792 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01792 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01792 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01792 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01792 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01792 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01792 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01792 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01792 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01792 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01792 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01792 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01792 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01792 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01792 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01792 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01792 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01792 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01792 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01792 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01792 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01792 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01792 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01792 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01792 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01792 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01792 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01792 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01792 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01792 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01792 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01792 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01792 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01792 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01792 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01792 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01792 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01792 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01792 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01792 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01792 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01792 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01792 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01792 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01792 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01792 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01792 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01792 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01792 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01792 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01792 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01792 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms