Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01658 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01658 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01658 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01658 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01658 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01658 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01658 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01658 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01658 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01658 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01658 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01658 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01658 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01658 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01658 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01658 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01658 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01658 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01658 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01658 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01658 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01658 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01658 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01658 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01658 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01658 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01658 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
P01658 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
P01658 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01658 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01658 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01658 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01658 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01658 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01658 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01658 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01658 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01658 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01658 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01658 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01658 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01658 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01658 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01658 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01658 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01658 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01658 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01658 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01658 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01658 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01658 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01658 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
P01658 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01658 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01658 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01658 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01658 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01658 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01658 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01658 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01658 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01658 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01658 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01658 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01658 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01658 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01658 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01658 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01658 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01658 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01658 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01658 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01658 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01658 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms