Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
P01653 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01653 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01653 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22■■□□□ 1.11
P01653 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
P01653 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01653 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01653 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01653 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01653 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01653 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01653 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01653 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01653 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01653 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01653 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01653 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01653 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01653 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01653 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01653 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01653 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01653 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01653 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01653 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01653 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01653 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
P01653 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01653 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01653 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01653 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01653 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P01653 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01653 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P01653 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01653 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01653 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01653 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01653 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01653 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01653 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01653 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01653 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01653 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01653 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01653 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01653 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01653 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01653 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
P01653 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01653 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01653 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01653 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01653 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01653 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01653 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01653 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01653 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01653 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01653 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01653 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01653 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
P01653 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01653 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01653 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01653 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01653 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01653 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01653 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01653 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01653 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01653 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01653 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01653 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01653 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01653 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01653 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01653 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01653 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01653 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P01653 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01653 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01653 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01653 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01653 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01653 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01653 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01653 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01653 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01653 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01653 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01653 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01653 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01653 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01653 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01653 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01653 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01653 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01653 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01653 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms