Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dync1i1O88485 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dync1i1O88485 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms