Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChkbO55229 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChkbO55229 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChkbO55229 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChkbO55229 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChkbO55229 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChkbO55229 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkbO55229 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChkbO55229 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkbO55229 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms