Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2a2O55143 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms