Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nipsnap2O55126 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap2O55126 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms