Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syngr2O55101 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms