Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Socs5O54928 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Socs5O54928 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Socs5O54928 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Socs5O54928 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Socs5O54928 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Socs5O54928 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Socs5O54928 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Socs5O54928 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms