Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb3O54890 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms