Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DffaO54786 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DffaO54786 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DffaO54786 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DffaO54786 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DffaO54786 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DffaO54786 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DffaO54786 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DffaO54786 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DffaO54786 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DffaO54786 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DffaO54786 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DffaO54786 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DffaO54786 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DffaO54786 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DffaO54786 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DffaO54786 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DffaO54786 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DffaO54786 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DffaO54786 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DffaO54786 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DffaO54786 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DffaO54786 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DffaO54786 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DffaO54786 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DffaO54786 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DffaO54786 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DffaO54786 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DffaO54786 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DffaO54786 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DffaO54786 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DffaO54786 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DffaO54786 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DffaO54786 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DffaO54786 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DffaO54786 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DffaO54786 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DffaO54786 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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DffaO54786 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DffaO54786 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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DffaO54786 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DffaO54786 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DffaO54786 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DffaO54786 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DffaO54786 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DffaO54786 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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DffaO54786 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DffaO54786 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DffaO54786 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DffaO54786 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DffaO54786 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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DffaO54786 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DffaO54786 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DffaO54786 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DffaO54786 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DffaO54786 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DffaO54786 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DffaO54786 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DffaO54786 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DffaO54786 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DffaO54786 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DffaO54786 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DffaO54786 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DffaO54786 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DffaO54786 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DffaO54786 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DffaO54786 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DffaO54786 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DffaO54786 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DffaO54786 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DffaO54786 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DffaO54786 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DffaO54786 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DffaO54786 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DffaO54786 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DffaO54786 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DffaO54786 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DffaO54786 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DffaO54786 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DffaO54786 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DffaO54786 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DffaO54786 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms