Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdaO54693 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EdaO54693 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EdaO54693 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EdaO54693 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EdaO54693 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EdaO54693 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EdaO54693 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EdaO54693 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EdaO54693 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EdaO54693 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EdaO54693 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdaO54693 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdaO54693 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdaO54693 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdaO54693 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EdaO54693 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdaO54693 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdaO54693 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdaO54693 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdaO54693 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdaO54693 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EdaO54693 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EdaO54693 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EdaO54693 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EdaO54693 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EdaO54693 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EdaO54693 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EdaO54693 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EdaO54693 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EdaO54693 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EdaO54693 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EdaO54693 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EdaO54693 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EdaO54693 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EdaO54693 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EdaO54693 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EdaO54693 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EdaO54693 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EdaO54693 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EdaO54693 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EdaO54693 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EdaO54693 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EdaO54693 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EdaO54693 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EdaO54693 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EdaO54693 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EdaO54693 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdaO54693 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdaO54693 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdaO54693 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdaO54693 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdaO54693 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdaO54693 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EdaO54693 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdaO54693 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdaO54693 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdaO54693 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdaO54693 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EdaO54693 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EdaO54693 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EdaO54693 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EdaO54693 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EdaO54693 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EdaO54693 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EdaO54693 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EdaO54693 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EdaO54693 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EdaO54693 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EdaO54693 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EdaO54693 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EdaO54693 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EdaO54693 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EdaO54693 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EdaO54693 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EdaO54693 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EdaO54693 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EdaO54693 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EdaO54693 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EdaO54693 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EdaO54693 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EdaO54693 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EdaO54693 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EdaO54693 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EdaO54693 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EdaO54693 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EdaO54693 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EdaO54693 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EdaO54693 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms