Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per1O35973 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per1O35973 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per1O35973 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Per1O35973 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Per1O35973 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Per1O35973 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Per1O35973 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Per1O35973 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Per1O35973 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Per1O35973 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Per1O35973 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Per1O35973 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Per1O35973 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Per1O35973 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Per1O35973 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Per1O35973 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Per1O35973 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Per1O35973 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Per1O35973 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Per1O35973 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Per1O35973 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Per1O35973 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Per1O35973 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Per1O35973 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Per1O35973 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Per1O35973 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Per1O35973 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Per1O35973 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Per1O35973 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Per1O35973 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Per1O35973 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Per1O35973 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Per1O35973 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Per1O35973 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per1O35973 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per1O35973 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per1O35973 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per1O35973 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per1O35973 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per1O35973 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per1O35973 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per1O35973 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per1O35973 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Per1O35973 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Per1O35973 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Per1O35973 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Per1O35973 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Per1O35973 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Per1O35973 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Per1O35973 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Per1O35973 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Per1O35973 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Per1O35973 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Per1O35973 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Per1O35973 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Per1O35973 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Per1O35973 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Per1O35973 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Per1O35973 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Per1O35973 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per1O35973 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per1O35973 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per1O35973 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per1O35973 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per1O35973 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per1O35973 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per1O35973 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per1O35973 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per1O35973 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Per1O35973 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Per1O35973 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Per1O35973 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Per1O35973 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Per1O35973 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Per1O35973 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Per1O35973 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Per1O35973 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Per1O35973 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Per1O35973 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Per1O35973 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Per1O35973 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Per1O35973 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Per1O35973 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Per1O35973 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Per1O35973 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Per1O35973 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Per1O35973 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Per1O35973 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Per1O35973 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per1O35973 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per1O35973 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per1O35973 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per1O35973 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per1O35973 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per1O35973 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Per1O35973 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per1O35973 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per1O35973 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per1O35973 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms