Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd2O35927 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd2O35927 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd2O35927 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms