Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptch2O35595 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptch2O35595 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptch2O35595 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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