Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gfra2O08842 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gfra2O08842 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra2O08842 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms