Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcof1O08784 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcof1O08784 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcof1O08784 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms