Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp35M0QWN7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp35M0QWN7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp35M0QWN7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms