Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Vmn2r88L7N1W8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Vmn2r88L7N1W8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Vmn2r88L7N1W8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r88L7N1W8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r88L7N1W8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r88L7N1W8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r88L7N1W8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Vmn2r88L7N1W8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r88L7N1W8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Vmn2r88L7N1W8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r88L7N1W8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r88L7N1W8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r88L7N1W8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r88L7N1W8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r88L7N1W8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Vmn2r88L7N1W8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Vmn2r88L7N1W8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Vmn2r88L7N1W8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn2r88L7N1W8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Vmn2r88L7N1W8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Vmn2r88L7N1W8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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