Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms