Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ccer2J3QPU5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccer2J3QPU5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ccer2J3QPU5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccer2J3QPU5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms