Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5294J3QP53 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5294J3QP53 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5294J3QP53 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5294J3QP53 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm5294J3QP53 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5294J3QP53 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5294J3QP53 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms